Pelayanan Anak Pantekosta (PELNAP) GPdI Maranatha diketuai oleh Ibu Marjatta Aritonang. Data terakhir Desember 2009 yl, jumlah anak sekolah Minggu GPdI Maranatha sekitar 1200 anak. Selain ibadah sekolah Minggu di GPdI Marantha, pelayanan anak ini juga mempunyai 22 cabang ibadah sekolah minggu, yang tersebar di kecamatan dan kelurahan kota Medan.

Pelayanan Remaja Pantekosta (PELRAP) GPdI Maranatha, terdiri dari anak-anak jemaat yang sedang duduk di bangku SMP dan SMA. Koordinator wadah ini adalah drg. Hana Sitompul. Mengadakan Ibadah setiap hari Sabtu, pkl. 17.00 wib di Ruang Doa (lantai I).

Pelayanan Pemuda Pantekosta (PELPAP) GPdI Maranatha selalu menjadi ‘penggerak’ acara-acara besar Pelrap dan Pelpap, baik berupa Celebration Service, Retreat, Outbond, dlsb. Sejak tahun 2008 Pelpap GPdI Maranatha diketuai oleh Sdri. Marisi (Ichi) Silaban. Ibadah diadakan setiap hari Sabtu, pkl. 19.00 wib. Pelayanan ini juga mempunyai puluhan jemsel (Jemaat Maranatha Sel).

Pelayanan Pria Pantekosta (PELPRIP) GPdI Maranatha mengadakan Ibadah setiap hari Rabu, pkl. 19.00 wib di Ruang Doa. Saat ini, koordinator Pelprip adalah Dr. DF. Sitompul, Setiap dua bulan sekali, Pelprip bersama Pelprup dan Pelwap mengadakan KKR bersama ke berbagai daerah dan pelosok Sumatera Utara.

Pelayanan Wanita Pantekosta (PELWAP) dipimpin oleh Pdt. Lenny A. Wakkary-Tampi. Ibadah Pelwap diadakan setiap hari Kamis, pkl. 15.30 wib di Ruang Doa Lantai I.
Pelayanan Tuna Wisma dan Pemulung (PELTUNWIS) dilayani oleh pelayan dan Jemaat GPdI Maranatha yang dikoordinir oleh Ibu Deby Panjaitan. Sekarang GPdI Maranatha memiliki 2 (dua) Rumah Singgah, yang menampung kaum tuna wisma dan para pemulung. Selain menyampaikan Firman Tuhan, para pelayan juga menyantuni mereka dengan kebutuhan pokok.
Pelayanan Profesi dan Usahawan Pantekosta (PELPRUP) GPdI Maranatha dikoordinir oleh Ir.Petrus ES. Ibadah diadakan satu bulan sekali. Bersama Pelprip dan Pelwap, Pelprup aktif mengadakan kunjungan dan KKR ke berbagai-daerah dan pelosok di Sumatera Utara.

Pelayanan Keluarga Muda (PELKAM) GPdI Maranatha adalah sebuah wadah pelayanan yang diikuti oleh keluarga-keluarga muda, yang berusia 50 tahun ke bawah. Ibadah Pelkam diadakan setiap hari Jumat pkl. 19.00 wib. Koordinator Pelkam ialah Bp. Anto Sinaga, SE
Pelayanan Pendoa Syafaat (PELDOFAT) GPdI Maranatha, mayoritas diikuti kaum wanita dan ibu-ibu. Ibadah Peldofat diadakan setiap hari Senin dan Rabu pkl. 15.30 di Ruang Doa. Berdoa untuk negara dan bangsa Indonesia, Penginjilan di seluruh dunia, Pertumbuhan Jemaat GPdI Maranatha, Pelayanan Gembala Pdt. M.D. Wakkary, dan banyak lagi. Wadah ini dikoordinir oleh Ibu Juliati.

Pelayanan Lembaga Pemasyarakatan (PELAPAS) GPdI Maranatha, melayani 9 LP dan Rutan di kota Medan. Setiap tahunnya merayakan Paskah dan Natal, dan puluhan warga binaan LP dan Rutan menerima baptisan air. Koordinator pelayanan ini ialah Pdm. Desby Seran.

Pelayanan Bantuan Kematian dan Sosial (PELBAKTISOS) GPdI Maranatha dikoordinir oleh Bp. Hosboby Simanungkalit, SE. Wadah ini memberikan bantuan sosial kepada warga jemaat yang mengalami kemalangan / dukacita, dan juga memberikan bantuan sosial kepada keluarga-keluarga pra-sejahtera.
Pelayanan Anak Jalanan (PELANJA) GPdI Maranatha melayani anak-anak jalanan ; pengamen, pengemis, dlsb, yang ada di beberapa titik lampu merah di Kota Medan. Ibadah diadakan di emperan pertokoan, trotoar, dll. Saat ini wadah Pelanja dikoordinir Sdri.Risma Tarigan

Pelayanan Musik (PELMUSIK) GPdI Maranatha membidangi Worship-Team ; Musisi, Worship-Leader, Singers, Tambourine, Banners, dan Soundman. Setiap hari Jumat, pkl. 19.00 wib mengadakan latihan bersama, sekaligus persiapan Ibadah Raya Minggu. Pelmusik dikoordinir oleh Bp. Petrus Ginting, SE
Pelayanan Janda Hana (PELDAHANA) GPdI Maranatha diikuti oleh Ibu-Ibu Hana (janda). Ibadah Peldahana diadakan setiap hari Selasa minggu kedua. Koordinatornya ialah Ibu Anche Colia.
Pelayanan Multimedia (PELIM) GPdI Maranatha melayani di bidang warta jemaat, LCD, website, rekaman audio-video khotbah dan perayaan, dll.